授業の目的

大量のデータを統合して生命現象を俯瞰する際には、単一の生物種のみを対象とするとは限らない。複数の生物種の情報を統合するには進化生物学に立脚した思考が必要となる。また、 AlphaFold2を代表として現代の生命情報解析には進化学的な見地が織り込まれていることがしばしばある。本講義では、進化生物学及び分子進化学の基礎的な知識・技法を修得するとともに、大規模データにより駆動される現代の生物学における進化学的解析の寄与について知識を深める。

教育内容

進化生物学の一般教養、系統樹推定・自然選択の検出などの分子系統学的手法並びに種間・集団・個体内細胞間比較によるオミクスの統合的解釈について講義する。また、分子進化学と他分野との融合についても講義する。

教育方法

パワーポイントや板書による講義を通じて知識を養い、実習を通じて解析技術を得る。また、適宜課題を出し、その解答を示すことにより知識の定着を図る。課題に関する模範解答を作成し、受講者全員に配布する。

卒業・学位授与の方針と当該科目の関連

DP1

授業内容(シラバス)

到達目標

生命情報科学を研究するにあたり、生命史を概観し生命現象の普遍性・系統特異性を見出すための進化生物学のリテラシーを身につける。分子系統解析などの分子進化学の基本的な手法を身につける。

評価方法

講義内の実習（30%）と期末レポート（70%）の結果から総合的に判断する。

準備学習(予習・復習等)

【講義時間外に必要な学修時間：60時間】
予習：講義中に事前に指定する講義内容のプリントを読み、疑問点を明確にしておく。実習に際しては事前にツールをインストールし、関連論文とREADMEを読む。
復習：講義内で出題する課題に対する解答を作成し、課題提出後に配布する模範解答と比較・検討する。

備考・その他

講義に関する質問はメールや対面で対応するとともに、重要な質問に対しては受講者全員で共有する。
【関連科目：ゲノム科学特論、生物配列解析特論、トランスオミクス特論】

教材