Web Syllabus(講義概要)
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生命データサイエンス特別講義Ⅰ
英文名 Special Lecture for Biomedical Data ScienceⅠ
科目概要 未来工学研究科(修士課程)生命データサイエンス専攻修士1年前期、特別講義、必修、講義、2単位
科目責任者  岡 浩太郎
担当者 (※は実務経験のある教員) 岡 浩太郎谷森 達渡辺 豪鎌田 真由美齋藤 裕榊原 康文河野 信島津 秀康荒井 康夫
講義室

授業の目的

本専攻で進める4つの研究分野(生命現象を可視化するための新規な技術の開発、物理化学的な手法による分子モデリングとその情報を理解するためのデザイン技術、機械学習のための新規なアルゴリズムの開発とプログラミングによる実装、新規な生命系データベースの作成と様々なデータモデリング手法の開発)について、分野を越えた理解と議論を行うために、当該分野の簡単なレビューを行うとともに、活発な議論を通して、生命データサイエンス研究の最前線についての理解を深める。

教育内容

科目分担者のそれぞれの研究分野における研究の動向についてレビューを行うとともに、研究の最前線を議論を通じて理解する。

教育方法

本講義は、ゼミナール形式で行う。議論の内容、自身の見解、考察等についてレポートを作成することにより理解を深める。発表内容や課題等については、適宜講評を行う。

卒業・学位授与の方針と当該科目の関連

DP1、DP3、DP4

授業内容(シラバス)

項目 内容 担当者 日時
1 イントロダクション
可視化技術の最前線1
講義全体のねらいと生命データサイエンス全般について講義する。 岡 浩太郎
4/6④
2 可視化技術の最前線2 最新の可視化技術について講義する。 岡 浩太郎
4/13④
3 可視化技術の最前線3 最新の可視化技術について講義する。 谷森 達
岡 浩太郎
4/20④
4 医療情報活用の最前線 最新の医療情報活用に関して講義する。 荒井 康夫
4/27④
5 分子モデリング・情報デザイン技術の最前線1 最新の分子モデリングと情報デザインの話題について講義する。 渡辺 豪
鎌田 真由美
5/11④
6 分子モデリング・情報デザイン技術の最前線2 最新の分子モデリングと情報デザインの話題について講義する。 渡辺 豪
鎌田 真由美
5/18④
7 分子モデリング・情報デザイン技術の最前線3 最新の分子モデリングと情報デザインの話題について講義する。 渡辺 豪
鎌田 真由美
5/25④
8 データベースとモデリング
研究の最前線1
大規模トランスオミクスデータとデータモデリングの手法の最新の話題について講義する。 河野 信
島津 秀康
6/1④
9 データベースとモデリング
研究の最前線2
大規模トランスオミクスデータとデータモデリングの手法の最新の話題について講義する。 河野 信
島津 秀康
6/8④
10 データベースとモデリング
研究の最前線3
大規模トランスオミクスデータとデータモデリングの手法の最新の話題について講義する。 河野 信
島津 秀康
6/15④
11 人工知能研究の最前線1 人工知能技術とその工学への応用について講義する。 榊原 康文
齋藤 裕
6/22③
12 人工知能研究の最前線2 人工知能技術とその工学への応用について講義する。 榊原 康文
齋藤 裕
6/29③
13 人工知能研究の最前線3 人工知能技術とその工学への応用について講義する。 榊原 康文
齋藤 裕
7/6③
14 まとめ1 生命科学分野におけるデータサイエンスの今後の展開についてパネルディスカッションを受講者とともに行う。 岡 浩太郎
谷森 達
渡辺 豪
鎌田 真由美
榊原 康文
齋藤 裕
河野 信
島津 秀康
荒井 康夫
7/13③
15 まとめ2 生命科学でのデータサイエンスの今後の展開についてパネルディスカッションを受講者とともに行う。 岡 浩太郎
谷森 達
渡辺 豪
鎌田 真由美
榊原 康文
齋藤 裕
河野 信
島津 秀康
荒井 康夫
7/13④
No. 1
項目
イントロダクション
可視化技術の最前線1
内容
講義全体のねらいと生命データサイエンス全般について講義する。
担当者
岡 浩太郎
日時
4/6④
No. 2
項目
可視化技術の最前線2
内容
最新の可視化技術について講義する。
担当者
岡 浩太郎
日時
4/13④
No. 3
項目
可視化技術の最前線3
内容
最新の可視化技術について講義する。
担当者
谷森 達
岡 浩太郎
日時
4/20④
No. 4
項目
医療情報活用の最前線
内容
最新の医療情報活用に関して講義する。
担当者
荒井 康夫
日時
4/27④
No. 5
項目
分子モデリング・情報デザイン技術の最前線1
内容
最新の分子モデリングと情報デザインの話題について講義する。
担当者
渡辺 豪
鎌田 真由美
日時
5/11④
No. 6
項目
分子モデリング・情報デザイン技術の最前線2
内容
最新の分子モデリングと情報デザインの話題について講義する。
担当者
渡辺 豪
鎌田 真由美
日時
5/18④
No. 7
項目
分子モデリング・情報デザイン技術の最前線3
内容
最新の分子モデリングと情報デザインの話題について講義する。
担当者
渡辺 豪
鎌田 真由美
日時
5/25④
No. 8
項目
データベースとモデリング
研究の最前線1
内容
大規模トランスオミクスデータとデータモデリングの手法の最新の話題について講義する。
担当者
河野 信
島津 秀康
日時
6/1④
No. 9
項目
データベースとモデリング
研究の最前線2
内容
大規模トランスオミクスデータとデータモデリングの手法の最新の話題について講義する。
担当者
河野 信
島津 秀康
日時
6/8④
No. 10
項目
データベースとモデリング
研究の最前線3
内容
大規模トランスオミクスデータとデータモデリングの手法の最新の話題について講義する。
担当者
河野 信
島津 秀康
日時
6/15④
No. 11
項目
人工知能研究の最前線1
内容
人工知能技術とその工学への応用について講義する。
担当者
榊原 康文
齋藤 裕
日時
6/22③
No. 12
項目
人工知能研究の最前線2
内容
人工知能技術とその工学への応用について講義する。
担当者
榊原 康文
齋藤 裕
日時
6/29③
No. 13
項目
人工知能研究の最前線3
内容
人工知能技術とその工学への応用について講義する。
担当者
榊原 康文
齋藤 裕
日時
7/6③
No. 14
項目
まとめ1
内容
生命科学分野におけるデータサイエンスの今後の展開についてパネルディスカッションを受講者とともに行う。
担当者
岡 浩太郎
谷森 達
渡辺 豪
鎌田 真由美
榊原 康文
齋藤 裕
河野 信
島津 秀康
荒井 康夫
日時
7/13③
No. 15
項目
まとめ2
内容
生命科学でのデータサイエンスの今後の展開についてパネルディスカッションを受講者とともに行う。
担当者
岡 浩太郎
谷森 達
渡辺 豪
鎌田 真由美
榊原 康文
齋藤 裕
河野 信
島津 秀康
荒井 康夫
日時
7/13④

到達目標

生命系のデータサイエンスの全貌と最前線について理解する。

評価方法

講義中の議論での発表内容(20%)と講義後のレポート(80%)。

準備学習(予習・復習等)

【講義時間外に必要な学習の時間:60時間】
予習:担当者が講義で使うハンドアウトについて事前に目を通して講義の準備をする。
復習:講義後に担当者から指定される課題について、文献等を調査し、レポートにまとめる。

備考・その他

本講義は、ゼミナール形式で行う。各教員からの講義内容、レビューについて活発な議論を行ってもらいたい。
【関連科目:生命データサイエンス特別研究Ⅰ・Ⅱ、生命データサイエンス特論演習Ⅰ】

教材

種別 書名 著者・編者 発行所
教科書 配布資料あり
参考書 正しい結果を得るためのイメージング&画像解析実践テキスト〜あなたの目的にあった顕微鏡の選択と撮像、定量解析フローの組み立て 小山 宏史 (編集), 加藤 輝 (編集), 亀井 保博 (編集) 羊土社
参考書 Python機械学習プログラミング 福島真太朗 (監修) インプレス
教科書
書名
配布資料あり
著者・編者
発行所
参考書
書名
正しい結果を得るためのイメージング&画像解析実践テキスト〜あなたの目的にあった顕微鏡の選択と撮像、定量解析フローの組み立て
著者・編者
小山 宏史 (編集), 加藤 輝 (編集), 亀井 保博 (編集)
発行所
羊土社
参考書
書名
Python機械学習プログラミング
著者・編者
福島真太朗 (監修)
発行所
インプレス